Conformément à la Convention de l'Instiut WUT-AMU, l'Université de Technologie Wuhan et Aix-Marseille Université ont créé le Comité de gestion conjoint, qui constitue l'organe décisionnel de l'Instiut WUT-AMU. Les membres du Comité de gestion conjoint sont recommandés par les deux parties et approuvés par le Comité de gestion conjoint. Les membres sont les suivants :

L'Institut WUT-AMU est géré sous la responsabilité d'un doyen. Les doyens exécutifs et les vice-doyens sont en charge de la gestion pédagogique et adminitrative sous la direction du doyen. L'équipe dirigeante est recommendée et approuvée par le Comité de gestion conjoint.  

• Doyen de l’Institut WUT-AMU: Wang Fazhou

• Doyen Exécutif Chinois de l’Institut WUT-AMU: SUN Taolei

• Doyen Exécutif Français de l’Institut WUT-AMU: ZHANG Cheng-Cai 

• Vice-Doyen de l’Institut WUT-AMU: LI Li、SHEN Lei